Devrimci Karargâh örgütünün ilk eylemi, 7 Ağustos 2008'de Üsküdar'daki Selimiye Kışlası'na havan mermileriyle saldırı düzenlenmesiydi. Örgüt ayrıca Karacaahmet Mezarlığı'na, Sütlüce semtinde bulunan AK Parti İstanbul İl Başkanlığı'na ve Beşiktaş'taki Bank Pozitif isimli bankanın vitrin camına bomba konulması eylemleriyle gündeme geldi. Özel yetkili Cumhuriyet Savcısı Kadir Altınışık'ın belirlemelerine göre Devrimci Karargâh örgütü 16 Haziran Hareketi başta olmak üzere pek çok yan terör örgütü de kurdu. 16 Haziran Hareketi'nin, "Ordu Darbe Yapar" tezini benimseyen ve ordu içerisinde özellikle Deniz Harp Okulu'nda örgütlenme faaliyetlerine ağırlık veren bir hareket olduğu bilgisi Devrimci Karargâh örgütü iddianamesinde yer alıyor. 16 Haziran Hareketi, komünist lider ve kuramcı Hikmet Kıvılcımlı'nın görüşlerini benimsiyor. Kıvılcımlı'nın da 12 Mart muhtırasını "Ordu kılıcını attı" başlıklı bir yazıyla alkışlayan bir teorisyen olduğu biliniyor.
