AĞCA 2006'da tahliye edilirken avukatlarının çok sayıda başvurusu oldu. Bunlardan ilki Üsküdar Ağır Ceza Mahkemesi'ne yapıldı. Üsküdar, görevsizlik kararı verdi ve görevli Mahkeme'nin Ağca'nın o dönemde tutulduğu Kartal Cezaevi'nin bağlı olduğu Kartal Ağır Ceza Mahkemesi'nin olduğuna işaret etti. Kartal da "ben görevli değilim" deyince dosya o dönemde Yargıtay'a geldi. Yargıtay 5'inci Ceza Dairesi Üsküdar Ağır Ceza'nın görevli olduğuna karar verdi. Üsküdar Ağır Ceza da Ağca'nın cezasını hesaplayarak 12 Ocak 2006'da salıverilmesi gerektiğine karar verdi. Ağca'nın avukatları bu kez aynı tarihi belirlemek için Kartal 1'inci Ağır Ceza Mahkemesi'ne başvurdular. Bu mahkeme de aynı tarihe işaret etti. Abdi İpekçi'nin avukatlarının itirazı üzerine tahliye talebi bu kez Kartal 2'nci Ağır Ceza'ya geldi. Hüseyin Öztürk'ün başkan, Kasım Özbey ve Neslihan Aboşoğlu'nun üye oldukları bu mahkeme 10 Ocak 2006'da yani tahliyeden 2 gün önce, "12 Ocak'ta tahliye edilmesi gerekir" diyen 1'inci Ağır Ceza Mahkemesi'nin kararının yerinde olduğuna karar verdi. Yani son kararı verdi.
