Hakkında yapılan yayınlarla tartışılan MİT Müsteşarı Hakan Fidan'a bir destek de Cumhurbaşkanı Abdullah Gül'den geldi. Japonya'nın Ankara Büyükelçisi Yutaka Yokoi'yi kabulünden önce gazetecilerin sorularını yanıtlayan Gül şunları söyledi:
MİT ve Müsteşarı, Türkiye'nin milli menfaatleri doğrultusunda görevlerini en iyi şekilde yerine getiriyorlar. Bu faaliyetlerden rahatsız olan çevreler olabilir. Son günlerde sistemli yazılan çizilenler var. Bunların hiç kimseyi etkilememesi gerekir. Türkiye'nin kendi bağımsız politikaları ve çıkarları her şeyin önünde gelir. Dolayısıyla dışarıda yazılıp çizilenler önemli değildir.
(Füze sistemi) Her ülkenin kendi milli menfaatlerini öne çıkartmasından daha tabii bir şey olamaz. Teknik meseleler hesaplanmış ve karar çıkmıştır. Gül, Suudi Arabistan gazetesi Okaz'a ise ABD ile İran arasındaki gelişmeleri değerlendirdi: Bunu yeni bir stratejik saf tutma olarak görmemeliyiz.