Başkent Tokyo'nun güneyinde yer alan Osaka'daki bir havacılık biriminin, depremin ardından gönderdiği uyarı mesajında Kuzey Kore'den füze saldırısı uyarısı verdiği bildirildi. Ulaştırma Bakanlığı, bu mesajın 87 havalimana ofisine ulaştığını, 1 uçuşun ertelenmesine neden olduğunu kaydetti. Bakanlık, hatalı mesajın 6 dakika sonra düzeltildiğini belirtti.
Kuzey Kore'den son dönemde yükselen tehditler nedeniyle Japonya, alarm durumuna geçmişti. Muhtemel bir füze fırlatma girişimine karşı hükümet, Tokyo'ya Patriot füzelerini yerleştirmişti. Ayrıca son teknoloji gemilerini de Japon Denizi'ne konuşlandırmıştı.