HSYK seçimlerinde çok ilginç sonuçlar da elde edildi. 12 bin 311 geçerli oydan 5 bin 836'sını alarak birinci sıradan HSYK üyesi seçilen Balıkesir Başsavcısı Metin Yandırmaz, Ergenekon soruşturması sırasında paralel yapıya yakın savcılar tarafından şüpheli olarak görülmüştü. 3 Kasım 2008'de İstanbul 10. Ağır Ceza Mahkemesi'nin kararıyla hakkında takip kararı alınan Yandırmaz, o dönem Kırıkkale Cumhuriyet Başsavcısıydı. Dönemin özel yetkili mahkemesi Yandırmaz'ın da olduğu 21 isim hakkında "4 hafta süreyle kamuya açık yerlerdeki faaliyetlerinin ve işyerlerinin teknik araçlarla izlenmesine, ses veya görüntü kaydı alınması" kararı verilmişti. Ancak, Yandırmaz hakkında bir şey bulunamadığı için takip dosyası da davaya dönüşmemişti. Yandırmaz böylelikle Ergenekon dosyasına "şüpheli" olarak girmişti. 35 oyla listenin sonunda yer alan Hâkim Hüsnü Çalmuk ise Ergenekon davası sırasında dönemin Özel Yetkili Mahkemesi İstanbul 13'üncü Ağır Ceza Mahkemesi'nin üyesiydi. Ergenekon davasında "naip hâkim" olarak bağımsız imza atan Çalmuk'un uygulamaları çok tartışılmıştı.