Ergenekon
davasında 'kumpas' kurulduğu iddiasıyla başlatılan soruşturma kapsamında kritik bir isim ifadeye çağrıldı. Ergenekon davasına bakan İstanbul 13. Ağır Ceza Mahkemesi'nin bir süre başkanlığını yapan ve yargılama sürecinde sanık avukatlarının tahliye taleplerine olumlu görüş bildirmesi ile dikkat çeken Köksal Şengün, İstanbul Cumhuriyet BaşsavcılığıTerör ve Örgütlü Suçlar Bürosu tarafından savcılığa davet edildi. Soruşturmayı yürüten Savcı Mesut Erdinç Bayhan'ın telefonla ulaştığı Şengün "bilgi sahibi" olarak ifadeye çağrıldı. Trabzon'da yaşayan Şengün'ün sağlık sorunları yaşadığı, rutin olarak İstanbul'a tedaviye geldiği, İstanbul'a geldiği zaman adliyeye gelip soruları cevaplayacağı öğrenildi. Birinci ve ikinci Ergenekon davaları kapsamında 100'ün üzerinde duruşmaya başkanlık yapan Şengün, üye hâkimlerin tutukluluğunun devamını istediği bazı sanıkların tahliyesi yönünde görüş bildiriyordu. Şengün, HSYK tarafından 13 Temmuz 2011'de Bolu'ya hâkim olarak atandı ve 21 Ağustos 2013'te emekli oldu. Eski Adalet Bakanı Seyfi Oktay ve bazı avukat arkadaşlarının telefonları teknik takibe alınmış bu takip sırasında Şengün'ün de bazı görüşmelerinin dinlendiği ortaya çıkmıştı.