Üniversite 22 Mayıs 2008 tarihinde 5765 sayılı Kanun ile kurulmuştur. Rektörlüğe bağlı olarak yeni kurulan İktisadî ve İdarî Bilimler fakültesi, Mühendislik Fakültesi ile İlahiyat Fakültesinden, Dicle Üniversitesi Rektörlüğüne bağlı iken adı ve bağlantısı değiştirilerek oluşturulan ve Rektörlüğe bağlanan Şırnak Meslek Yüksekokulu ile Cizre Meslek Yüksekokulundan, Rektörlüğe bağlı olarak yeni kurulan Sosyal Bilimler Enstitüsü ile Fen Bilimleri Enstitüsünden oluşmaktadır. Üniversitenin rektörü Ali Akmaz'dır.

Şırnak Üniversitesi Akademik Birimleri

Üniversite'de 8 akademik birim faaliyet göstermektedir:

- İktisadi ve İdari Bilimler Fakültesi
- İlahiyat Fakültesi
- Mühendislik Fakültesi
- Sosyal Bilimler Enstitüsü
- Fen Bilimleri Enstitüsü
- Turizm ve Otel İşletmeciliği Yüksek Okulu
- Şırnak Meslek Yüksek Okulu
- Cizre Meslek Yüksek Okulu

Fiilen Eğitim-Öğretime Başlamış Bölümler

İktisadi- İdari Bilimler:
- İktisat
- İktisat (İ.Ö.)
- İşletme

Mühendsilik Fakültesi:
- İnşaat Mühendisliği
- İnşaat Mühendisliği (İ.Ö.)
- Enerji Sistemleri Mühendisliği

İlahiyat Fakültesi:
- İlahiyat

Şırnak Meslek Yüksek Okulu:
- Elektrik
- Çocuk Gelişimi
- Makine
- Muhasebe ve Vergi Uygulamaları
- Elektrik

Cizre Meslek Yüksek Okulu:
- Bilgisayar Teknolojisi ve Programlama
- Muhasebe ve Vergi Uygulamaları
- Çocuk Gelişimi

Kütüphane
Üniversitenin çağdaş ve zengin bir kütüphanesi vardır.