Beşiktaş'tan yıllık 3.5 milyon Euro isteyen Manuel Fernandes eleştirilen performansına rağmen, geçtiğimiz sezon ve bu sezonun geride kalan maçlarında skora yaptığı katkıyla kulübün kasasına talep ettiği rakamın hemen hemen yarısını kazandırdı. Fernandes kulübünün TFF'den prim olarak 2012-13 sezonunda 7 gol ve 8 asist ile
3.6 milyon TL, 2013- 14'de ise 9 maçta 1 gol ve 5 asistle
1.3 milyon TL almasını sağladı. Toplamda kazandırdığı para Euro bazında
1.8 milyon oldu.
