2012-2013 sezonunda, ikinci ligde şampiyon olarak PTT 1. Lig'e yükselen Balıkesirspor, transferlerle oluşturduğu yeni kadrosuyla ilk yarının dikkatleri çeken ekibi oldu.
Ligin 2nci' haftasında liderlik koltuğuna oturan ve 5 haftada 5 galibiyetle 15 puan toplayan kırmızı-beyazlılar, ilk yenilgisini 6'ncı haftada Gaziantep Büyükşehir Belediyespor'a karşı aldı. Buna rağmen liderliğini sürdüren Balıkesirspor, 9'uncu haftada Samsunspor'a deplasmanda mağlup olunca 3'üncü sıraya geriledi.
11 ve 12'nci haftada iç ve dış sahada kaybeden Balıkesir ekibi, lider Orduspor'un 7 puan gerisine düştü. Adanaspor ve Orduspor'u deplasmanda yenen ekip, son haftalara kadar özellikle kritik maçlarda çıkardığı puanlarla iddiasını sürdürdü.
Lider İstanbul Büyükşehir Belediyespor'un 4, ikinci Ankaraspor'un 2 ve Orduspor'u 1 puan gerisinde 35 puanla 4'üncü sırada bulunan kırmızı-beyazlılar, 18 maçın 11'inden galibiyet, 2'sinden beraberlik ve 5'inden de yenilgiyle ayrıldı.
Ligin en az berabere kalan takımı olan Balıkesirspor, ilk yarıda, 31 gol atarken, kalesinde 18 gol gördü. Takımın en fazla gol atan oyuncuları 10 golle Muhammet Reis ve 9 golle Karikari oldu.
PTT 1. Lig'in en fazla konuşulan, "flaş ekip" olarak nitelendirilen Balıkesirspor, şampiyonluk iddiasını sürdürmek ve üst lige yükselmek hedefiyle ara transfer çalışmalarına da hızlı başladı. Kırmızı-beyazlılar, doğrudan ilk 11'de forma giyecek oyuncular transfer etmeyi istiyor.
