2009 (3 istifa): Hava Harp Okulu'nun komutanı Tümgeneral Sinan Şanlı ile Ege semalarında yaşanan 'it dalaşları' da dahil en kritik operasyonları yapan 1. Taktik Hava Kuvvet Komutanlığı'nın 'iki numarası' Tümgeneral Levent Türkmen, 5 Mayıs 2009'da istifalarını vererek görevlerinden ayrıldı. İstifalarla ilgili çeşitli ididalar ortaya atıldı. Ergenekon ve Karargâh Evleri operasyonu bu iddialardan bazılarına alt yapı oldu. Tümgeneral Türkmen ve Tümgeneral Sinan Şanlı basında çıkan haberler üzerine yaptıkları açıklamada tamamen kendi şahsi irade ve istekleri ile ayrıldıkların, herhangi bir baskı, telkin ve teklif olmadığını vurguladılar. TSK'dan ayrılan son general ise Deniz Kuvvetleri Değerlendirme ve Denetleme Başkanlığı Komutanı Tümamiral Mustafa Baha Eren oldu.
