İstanbul 10. Ağır Ceza Mahkemesi tarafından kabul edilen ve ilk duruşması 16 Aralık'ta yapılacak olan dava iddianamesinde 5 aşamalı Balyoz Harekât Planı'nın nihai amacının hükümeti devirmek olduğu belirtiliyor. Buna göre:
1. AŞAMA: İstihbarat faaliyetleri, fişleme safhası, mühimmatın dağıtılması
2. AŞAMA: Askeri müdahale için zemin hazırlama süreci
3. AŞAMA: Önce olağanüstü hal ve ardından sıkıyönetim ilan ederek, askeri bir müdahale ile Türkiye Cumhuriyeti hükümetini iktidardan zorla uzaklaştırmak
4. AŞAMA: Yürütme görevinin "Milli Mutabakat Hükümeti" ne bırakılması
5. AŞAMA: Seçim
