Çoğu verilere göre El Kaide ile onun yarattığı hareketin, uzun süredir terörist operasyonların yönetiminden uzak kalan Üsame Bin Ladin'in öldürülmesinden doğrudan etkilenme ihtimali yok. Ancak bu küresel terör şebekesinin kurucusu ve manevi önderi olan Bin Ladin'in ölümü, onun temsil ettiği şiddet düşkünü aşırılıkçılığın cazibesini daha da azaltabilir. Ulusal Harp Akademisi'nde terörizm çalışmaları yapan Audrey Kurth Cronin, "Bu ölümün sembolik önemi çok büyük. Ancak konu El Kaide olunca, Bin Ladin'in pratik önemi 11 Eylül saldırıları zamanındaki kadar büyük değil" diyor. Uzun zamandır El Kaide'nin iki numaralı lideri olan, Bin Ladin'in en muhtemel halefi Eymen El Zevahiri, Ocak ile Nisan arasında beş mesaj yayınladı. Zevahiri bu mesajlarda, Arap dünyasındaki isyanlarla 2001 saldırılarının ardındaki cihatçı fikirler arasında bağlantı kurmaya çalıştı. Ancak cihatçı savaş sloganlarıyla isyanlar arasında yakın bir ilişki yoktu. Hatta Zevahiri bu mesajlarda, Arap dünyasındaki gelişmelerin gerisinde kaldıkları için özür bile diledi ve bunun nedeni olarak da kaçak yaşamalarını gösterdi. Zevahiri'nin Ortadoğu'daki sorunların çözümü olarak El Kaide ideolojisini kabul ettirme girişimi, Bin Ladin'in ölümünün ardından daha da zorlaştı. Bin Ladin ile birlikte Afganistan'da savaşan eski cihatçı Muhammed Ömer Abdül Rahman, El Kaide'nin kurucusunun son on yıldır örgüte liderlik etmediğini söylüyor. 38 yaşındaki Abdül Rahman, "O her zaman bir semboldü. Ancak çok sıkı takip edildiği için harekete liderlik ve yöneticilik yapamıyordu" diyor. Abdül Rahman, Bin Ladin'in ölümüyle ilgili "İnsanlar bunu kalplerinde hissedecek, ama eylemler açısından bakılacak olursa ölümünün bir etkisi olmayacak" yorumunda bulunuyor. Bin Ladin'in 2 Mayıs'ta Pakistan'da ölmesinin etkileri sınırlıysa bu kısmen, onun ortak bir ideolojiyi paylaşan, merkeziyetçilikten uzak gruplardan oluşan küresel bir hareket yaratmaktaki başarısından kaynaklanıyor. Yemen, Kuzey Afrika ve Somali'deki El Kaide'yle bağlantılı gruplar, içlerinde ABD ve Avrupa'ya yönelik saldırıların da olduğu daha önemli roller üstlendi.