Bireylerin haklarının ihlal edildiği iddiasıyla kullandıkları "bireysel başvuru" hakkından, 12 Eylül Darbesi Davası'nın sanıkları Kenan Evren ve Tahsin Şahinkaya da yararlanmak istedi. Evren ve Şahinkaya, 1982 Anayasası'nda referandumla yapılan değişiklikle Türk hukuk sistemi içine dahil olan hak çerçevesinde Anayasa Mahkemesi'ne yaptıkları başvuruda Ankara 12'nci Ağır Ceza Mahkemesi'nde görülen 12 Eylül davası sırasında yapılan işlemlerin temel hak ve özgürlüklerini zedelediğini ve Anayasal haklarının ihlal edildiğini savundular.