Ankara Cumhuriyet Başsavcılığı, 27 Nisan e-muhtırası soruşturması kapsamında Genelkurmay Başkanlığı'na, bir yazı göndererek dönemin Genelkurmay Başkanı Yaşar Büyükanıt'ın, "Cumhuriyetin temel değerlerine sözde değil, özde bağlı olacak bir kişinin cumhurbaşkanı seçilecek olmasını umut ediyoruz" dediği 12 Nisan 2007'deki basın toplantısı öncesinde ve sonrasında, "Karargâhta toplantı yapıldı mı?" diye sormuştu. Genelkurmay, cevap yazısında, toplantı yapılmadığını ve icrai bir karar alınmadığı bildirildi.