Milli Savunma Üniversitesi teşkilatının oluşturulmasına ilişkin Bakanlar Kurulu kararı, Resmi Gazete'de yayımlandı. Kararla üniversitenin akademik birimleri, yönetim organları, danışma ve idari yönetim birimleri belirlendi. Buna göre, rektörlüğe bağlı Kara Harp Okulu, Deniz Harp Okulu, Hava Harp Okulu, Kara Astsubay Meslek Yüksekokulu, Deniz Astsubay Meslek Yüksekokulu, Hava Astsubay Meslek Yüksekokulu, Bando Astsubay Meslek Yüksek Okulu, Kara Harp Enstitüsü, Deniz Harp Enstitüsü, Hava Harp Enstitüsü, Müşterek Harp Enstitüsü, Atatürk Stratejik Araştırmalar Enstitüsü, Alparslan Savunma Bilimleri Enstitüsü, Barbaros Deniz Bilimleri ve Mühendisliği Enstitüsü, Hazerfan Havacılık ve Uzay Teknolojileri Enstitüsü, Milli Savunma ve Güvenlik Enstitüsü ile Fatih Harp Tarihi Araştırmaları Enstitüsü'nden oluşacak. Birimlerin görev dağılımı ile bunların altında yer alacak alt birimler, rektörün teklifi üzerine Milli Savunma Bakanı'nın onayı ile düzenlenebilecek.