Selçuk İnan, futbola doğduğu şehrin kulübü olan Karaağaç Belediyespor'da amatör olarak başladı. 14 yaşındayken, Mehmet Kurt isimli antrenörünün tavsiyesiyle Çanakkale Dardanelspor'a gitti. Seçmelerde beğenilerek üç yıllığına takımıyla anlaştı. Bekar futbolcuların evde kalması yasak olduğu için kulübün tesislerinde kaldı ve liseyi de Çanakkale'de bitirdi. 2,5 sezon PAF takımda oynadıktan sonra takımın başına Metin Tekin'in geçmesiyle A takıma yükseldi. A takımda sürekli olarak oynayan Selçuk, dört yıl oynadığı takımda 76 lig maçına çıkıp 6 gol attı.

2005-06 sezonunun devre arasında Ersun Yanal yönetimindeki Manisaspor'a transfer olarak, yeni takımıyla 4,5 yıllık sözleşme imzaladı. İlk lig maçına 21 Ocak 2006'da MKE Ankaragücü ile oynanan maçta çıkarken, ilk golünü iki hafta sonraki 3-1 kazanılan Sivasspor karşılaşmasında attı. Sezon sonuna kadar çoğu maçta görev alan Selçuk, 2006-07 sezonunda takımın değişmezlerinden biri oldu. Kulübü gibi kendisi de lige çok iyi başlamasına rağmen, ilerleyen haftalarda düşüşe geçti. O sezon oynadığı 2751 dakika ile takımının en fazla forma giyen ikinci ismi oldu. Ertesi sezon adeta takımının kaptanı olan Selçuk, gösterdiği performansla büyük kulüplerin transfer listesine girdi. Sezon boyunca 30 maça çıkıp 5 gol atmasına rağmen takımının küme düşmesini engelleyemedi.

Selçuk İnan, Manisaspor'un kümeye düşmesinin ardından 31 Mayıs 2008 tarihinde eski teknik direktörü Ersun Yanal'ın başında olduğu Trabzonspor'la 3 yıllık sözleşme imzaladı. Yeni kulübünde 8 numaralı formanın yeni sahibi olan Selçuk, ilk lig maçına sezonun ilk haftasındaki Ankaraspor ile oynanılan ve 2-0 kazanılan karşılaşmada çıkarken, ilk lig golünü de bu maçta attı. Bir sonraki haftayı da boş geçmeyen genç futbolcu, 1 Kasım 2008 tarihli 4-0 biten İstanbul Büyükşehir Belediyespor maçında takımının ikinci golünü atarak Trabzonspor'un tarihindeki 2000. golüne imza attı. Sezon boyunca istikrarlı performansını sürdüren Selçuk, teknik direktör Ersun Yanal'ın takımdan ayrılmasından sonraki ilk maç olan Kayserispor maçında oynamadığı için basında eski teknik direktörünün gidişine üzüldüğü ve kulübe tepki gösterdiği haberleri çıktı. Ancak daha sonra karşılaşmaya sağlık sorunları nedeniyle çıkamadığını açıkladı. Başarılı futbolcu bordo mavili takımdaki ilk sezonunda 32 maçta forma giyip 3 gol atmıştır.

Selçuk İnan, 2009-10 sezonunda çıktığı ilk maç olan Sivasspor karşılaşmasında gol atarak, bir önceki sezon olduğu gibi bu sezonda da takımının ligdeki ilk golünü attı. Şenol Güneş'in takımın başına gelmesiyle çoğu maçta 90 dakika forma giyen Selçuk, sakat olduğu Manisaspor ve Ankaragücü maçları hariç tüm karşılaşmalarda forma giydi. İlk kez bir kupa sevinci yaşadığı Türkiye Kupası'ndaki tüm karşılaşmalarda forma giyerken Fenerbahçe ile oynanılan final maçında takımı mağlupken Umut Bulut'a attırdığı beraberlik golüyle bordo-mavilileri ateşleyen Selçuk, kupanın kazanılmasında büyük pay sahibi oldu. Sezon boyunca 28 maça çıkıp 2 gol kaydeden başarılı orta saha oyuncusu, sezonun sona ermesiyle milli takımın ABD'deki hazırlık kampı kadrosunda da yer aldı.

2010-11 sezonunda ligde tam 33 maça çıkan ve bu maçların tümünde 90 dakika forma giyen yıldız oyuncu, attığı iki golün yanı sıra tam 13 asist yaparak ligde bu alanda zirvedeki isimler arasında yer aldı. Takımının pas dağıtımını gerçekleştiren ve oyunu yönlendiren bir numaralı isim olan Selçuk, son haftaya dek müthiş bir performans sergilese de Trabzonspor'un averajla şampiyonluğu kaybetmesine engel olamadı. Sezon başında Bursaspor ile oynadıkları Süper Kupa maçında da bir asist yapma başarısı gösterdi.

2011-12 sezonundan itibaren geçerli olmak kaydıyla Galatasaray ile 5 yıllık sözleşme imzaladı. Galatasaray'da Süper Lig'teki ilk golünü, aynı zamanda ilk resmi golünü Süper Lig'in 2011-12 sezonunun 2. haftasında oynanan Samsunspor karşısında penaltıdan kaydetmiştir. Galatasaray taraftarları tarafındanda çok sevilen Selçuk ilk sezonunda ise kendi kariyer rekorunu kırmıştır ve Galatasaray'ın başarısında Felipe Melo ile birlikte büyük pay sahibi olmuştur. Duran toplarıda çok etkili kullanan Selçuk, duran toplardan hem asistler yapmış, hem de kendi adına goller atmıştır.

Attığı 3 frikik golüyle Selçuk İnan kariyerinde en çok frikik golü attığı sezonu yakalamıştır. Selçuk İnan 8 Nisan 2012'de oynanan Manisaspor maçında Eski takımı Manisaspor'a biri 30 metre'den diğeri ise penaltıdan olmak üzere iki gol atmıştır ve 34 haftalık maratonu 11 gol ve 12 asist ile tamamlayarak Double-Double yapmıştır. 22 Nisan 2012 tarihinde TT Arena'da oynanan Fenerbahçe derbisinde serbest vuruştan gol atan Selçuk, Süper Final 3. hafta maçında eski takımı Trabzonspor'a 1 gol (frikik) ve 1 asist ile takımının 2 golünde direkt katkı sağladı. Ayrıca Selçuk İnan'ın bu frikik golü Galatasaray kulüp tarihinde Gheorghe Hagi'nin 2000-2001 sezonunda 5 gollük rekorunu egale etmiş oldu. Sezon sonunda şampiyonluğa ulaşan Galatasaray ile birlikte kariyerinin ilk Süper Lig şampiyonluğunu elde etti. 2012-2013 sezonunda Spor Toto Süper Lig'de ilk golünü 2. hafta oynanan Beşiktaş derbisinde kaydetti. Galatasaray'da 57 maçta 16 gol ve 22 asist yapma başarısını göstermiştir.

Selçuk İnan 2012-13 sezonundaki ilk frikik golünü Galatasaray'ın Fenerbahçe'yi 2-1 mağlup ettiği derbide atmıştır. Bir sonraki golünü Orduspor'a atan Selçuk, ayrıca bu maçın henüz 5. dakikasında kendi kalesine şanssız bir şekilde gol atmıştır. Selçuk İnan 5 Mayıs 2013 günü oynanan Sivasspor müsabakasında 1'i frikik olmak üzere 2 gol atmış ve Galatasaray'ın bu maçı kazanmasında büyük pay sahibi olmuştur. Ayrıca bu maçın sonunda bitime 2 hafta kala en yakın takipçisi Fenerbahçe'nin 10 puan önüne geçen Galatasaray 19. Şampiyonluğunu ilan etmiş, böylelikle Selçuk Galatasaray'da ikinci sezonunda da Şampiyonluk yaşamıştır.

Milli takıma ilk kez Şubat 2007'de Gürcistan ile oynanan maçta çağrılmasına rağmen sakatlığı nedeniyle forma giyemedi. Selçuk, milli takımının formasını ilk kez 13 Ekim 2007'de Moldova ile oynanılan hazırlık maçında giydi. 2012 Avrupa Kupası ön elemelerinde takımın vazgeçilmezlerinden olmuş ve çok fazla asist yaparak takımına katkıda bulunmuştur. Türkiye 19 Yaş Altı Milli Futbol Takımı ile 2004 yılında düzenlenen UEFA 19 Yaş Altı Şampiyonası'na katıldı ve final oynadı. 2011'de Guus Hiddink tarafından milli takıma çağırılan Selçuk neredeyse tüm maçlarda ilk 11 başladı ve birçok asist yaptı. Selçuk Ay-Yıldızlı formayla ilk golünü Gürcistan'a 24 Mayıs 2012 tarihinde penaltıdan attı. Türkiye'nin Salzburg kampında sadece Gürcistan maçında oynayan Selçuk, Türkiye'nin Portekiz ile oynadığı maçın 80. dakikasında oyuna dahil olmuş ve 88. dakikasında Pepe'nin kendi kalesine attığı golün asistini yapmıştır ve Türkiye maçtan 3-1 galip ayrılmıştır. Selçuk ikinci golünü ise 11 Eylül 2012'de Estonya'ya atmıştır.