Çetin Doğan, Fatih Altaylı'nın Haber Türk'teki Teke Tek programında, kendisine soru soran gazetecilere, "AK Parti yeni iktidara gelmişti. Ak paktı. Neden bir darbe planı hazırlayalım?" demişti. Oysa Balyoz iddianamesinde, 17 Aralık 2002 tarihli bir belgeden söz ediliyor. Bu belge, Birinci Ordu Komutanlığı'ndan bağlı birimlere "irticai faaliyetler yakın takibe alınsın" diye Çetin Doğan tarafından gönderilmiş. Yani, Çetin Doğan'ın gözünde, AK Parti, o zaman da pek ak pak değil. Doğan'ın bu talimatı üzerine, dönemin 2. Kolordu Komutanı Engin Alan (şimdi Balyoz tutuklusu), 4. Mekanize Piyade Tugay Komutanlığı'na "gizli" ibareli bir talimat göndererek, TSK personelinin, irticai faaliyetler açısından izlenip, ev ziyaretleri adı altında fişlenmesini, okullar ile kamu kurum ve kuruluşlarındaki laikliğe karşı olarak değerlendirilen başörtüsünün yakın takibe alınmasını istiyor. Ayrıca, Milli Eğitim'in muhtelif seviyelerdeki 6 bin vekil müdürü görevden alıp yenilerini aşamalı olarak atayacağından söz ederek, gelişmeye hassasiyet gösterilmesi talep ediliyor. Ajan olarak, okullardaki Milli Güvenlik Bilgisi derslerine giren öğretmenlerin kullanılacağı bildiriliyor.