1. DALGA: 12 Haziran 2007'de Ümraniye'de bir gecekondunun çatı katında, sandık içinde 27 el bombası, TNT kalıpları ve fünyeler bulundu. Emekli binbaşı Fikret Emek ve emekli yüzbaşı Gazi Güder'in de aralarında bulunduğu şüpheliler gözaltına alındı.
2. DALGA: 26 Ağustos 2007'de yazar Ergun Poyraz ve 'Yeşil' kod adlı Mahmut Yıldırım'ın adamı olarak bilinen Mete Yalazangil tutuklandı.
3. DALGA: 21 Ocak 2008'de emekli Tuğgeneral Veli Küçük, emekli Kurmay Albay Mehmet Fikri Karadağ, Kemal Kerinçsiz, gazeteci Gülay Kömürcü, Susurluk hükümlüsü Sami Hoştan, 'Drej Ali' olarak tanınan Ali Yasak ve Sevgi Erenerol'un da aralarında bulunduğu 31 kişi gözaltına alındı.
4. DALGA: 21 Şubat 2008'de akademisyenlere yönelik operasyonda Doç. Dr. Ümit Sayın, Doç. Dr. Emin Gürses, emekli astsubay Orhan Tunç, Hayrettin Ertekin gözaltına alındı.
5. DALGA: 22 Mart 2008'de İP Genel Başkanı Doğu Perinçek, eski İ.Ü. Rektörü Prof. Dr. Kemal Alemdaroğlu ve İlhan Selçuk'un da aralarında bulunduğu 13 kişi gözaltına alındı.
6. DALGA: 1 Temmuz 2008'de eski komutanlar Şener Eruygur, Hurşit Tolon, gazeteci Mustafa Balbay ile birlikte 16 kişi gözaltına alındı.
7. DALGA: 23 Temmuz 2008'de Konya'da 13, İstanbul'da 5, Kocaeli'nde 6, Elazığ ve Mersin'de birer kişi gözaltına alındı.
8. DALGA: 18 Eylül 2008'de 15 muvazzaf subay ile Hamza Demir, gözaltına alındı.
9. DALGA: 23 Eylül 2008'de eski Belediye Başkanı Gürbüz Çapan, İstanbul Organize Suçlar Şubesi eski müdürü Adil Serdar Saçan ve Tuncay Özkan'la birlikte 16 kişi gözaltına alındı.
10. DALGA: 12 Ocak 2009'da eski MGK Genel Sekreteri Tuncer Kılınç, eski YÖK Başkanı Prof. Dr. Kemal Gürüz ve İbrahim Şahin'in aralarında bulunduğu 33 kişi gözaltına alındı, 17'si tutuklandı.
11. DALGA: 23 Ocak 2009'da Avrasya Televizyonu'nda (ART) ve Türk Metal Sendikası Genel Merkezi'nde arama yapıldı. 16 ilde 40 kişi gözaltına alındı. Mustafa Özbek'le birlikte 7'si asker, 10'u polis 18 kişi tutuklandı.
12. DALGA: 13 Nisan 2009'da ÇYDD Genel Başkanı Prof.Dr.Türkan Saylan'ın evi ve dernekte aramalar yapıldı. Gözaltına alınan 40 kişiden Prof. Dr. Mehmet Haberal, Prof. Dr. Erol Manisalı'nın da bulunduğu 5 kişi tutuklandı.
13. DALGA: 3 Haziran 2009'da emekli üsteğmen avukat Serdar Öztürk'ün bürosunda Kurmay albay Dursun Çiçek'in imzası bulunan "İrticayla Mücadele Eylem Planı"nın fotokopisi bulundu.
14. DALGA: 15 Şubat 2010'da Erzincan Başsavcısı İlhan Cihaner ile 3'üncü ordu Komutanı Saldıray Berk ve MİT görevlilerinin de aralarında bulunduğu 14 kişi hakkında dava açıldı.
15. DALGA: 22 Mart 2010'da avukat Yusuf Erikel ile yayıncı Hayri Bildik'in de aralarında bulunduğu 10 kişi gözaltına alındı.
16.DALGA: 1 Haziran 2010'da eski Adalet Bakanı Seyfi Oktay ve 6 avukat "yargıyı etkilemekten" gözaltına alındı.
17. DALGA: 14 Şubat 2011'de Soner Yalçın ile sahibi olduğu internet sitesi 'Odatv' nin 3 yönetisi tutuklandı
