Bilim adamlarıyla yapılan görüşmede proje için 8 temel ilke belirlendi. İlkeler şöyle:
İstanbul'un tarihi, kültürü, kentsel kimliği ve dokusuyla uyumlu olacak.
Haydarpaşa gar binası başta olmak üzere tüm tarihi yapılar korunarak yaşatılacak.
Çevreyle barışık, çevreye zarar vermeyen bir proje uygulanacak.
Halen Trakya yakası yüzde 97, Anadolu yakası yüzde 3 olan turizm dengesizliğinin homojenize olmasına katkı sağlanacak.
Yük limanının tasfiyesi ile kamyon ve tır trafiği azaltılacak, görüntü ve gürültü kirliliği ortadan kaldırılacak.
Proje ile 10 binlerce vatandaşa istihdam alanı olacak.
Tüm proje alanı halkın kullanımına açılacak.
Projeden elde edilecek gelirler yeni hızlı tren hatlarının yapımında kullanılacak.