Tasarruf Mevduatı Sigorta Fonu (TMSF) ile şimdiye kadar iki protokol yapan ve davalık olan Halis Toprak, sonunda kurumla el sıkıştı. Buna göre TMSF, Toprak Grubu'nun Fon'a olan borçlarına karşılık bazı gayrimenkullerini alacak, el koyduğu şirketleri ise geri verecek. TMSF'den yapılan açıklamaya göre, 30 Kasım 2001 tarihinde Fon'a devredilen Toprakbank'ın hakim ortağı Toprak Grubu şirketleri ile Halis Toprak, Ahmet Toprak ve Mehmet Toprak arasında borçlarının ödenmesine yönelik olarak protokol imzalandı. Toprak Grubu'nun, borçları bir kısım taşınmazların ayni tahsilat yoluyla Fon tarafından devralınması suretiyle tasfiye edildi. TMSF ve Toprak Grubu karşılıklı davalardan vazgeçecek. Toprak Grubu'nun 21 sanayi tesisinin yönetimi 29 Haziran 2012'de yani bin 56 gün sonra tekrar Halis Toprak'ın Yönetim Kurulu Başkanlığı'nda Toprak Ailesi'ne geçecek.