Ağız kokusunun en önemli nedenleri; diş ve kulakburun- boğazla ilgili problemlerdir. Midede boşalma güçlüğü, mide fıtığı ve reflü hastalığı gibi nedenler ise çok nadiren de olsa ağız kokusuna yol açabilirler. Başka bir şikayeti olmayıp, salt ağız kokusu olan birinde bunu salt reflüye bağlamak ise son derece zordur.